25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2823 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2745  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2823  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2914  Ion transport 2 domain-containing protein  88.97 
 
 		 136 aa  246  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1713  Ion transport protein  42.96 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0380308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1737  hypothetical protein  45.86 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372846  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44180  voltage-dependent potassium channel  40.56 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0536818  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  29.5 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  31.78 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  36.14 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  34.18 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  34.94 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4033  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  30.95 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  32.29 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  30.23 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0962  Ion transport 2 domain-containing protein  26.17 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.318129  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4979  hypothetical protein  24.65 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4684  hypothetical protein  24.65 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0831777  normal  0.858819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4596  hypothetical protein  24.65 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  33.93 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0877  hypothetical protein  28 
 
 		 175 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  29.82 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  33.93 
 
 		 172 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  31.67 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4133  hypothetical protein  23.39 
 
 		 154 aa  40  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>