26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0877 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0877  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  357  4e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4133  hypothetical protein  54.35 
 
 
154 aa  137  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4596  hypothetical protein  33.8 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4684  hypothetical protein  33.8 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0831777  normal  0.858819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4979  hypothetical protein  33.8 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3124  ion transport 2 domain-containing protein  32.62 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4033  hypothetical protein  27.81 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  31.97 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  32.79 
 
 
145 aa  62  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  39.74 
 
 
159 aa  61.6  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  29.81 
 
 
142 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  28.43 
 
 
142 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  26.32 
 
 
148 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44180  voltage-dependent potassium channel  36.76 
 
 
149 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0536818  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  30.95 
 
 
132 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1713  Ion transport protein  30.12 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0380308  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  27.4 
 
 
143 aa  48.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  27.66 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  32.76 
 
 
361 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1737  hypothetical protein  30.77 
 
 
157 aa  44.3  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2914  Ion transport 2 domain-containing protein  26.14 
 
 
136 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  25.53 
 
 
160 aa  42.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2823  Ion transport 2 domain-containing protein  28 
 
 
138 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  31.68 
 
 
161 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2745  Ion transport 2 domain-containing protein  28 
 
 
138 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  27.27 
 
 
141 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>