26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44180 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_44180  voltage-dependent potassium channel  100 
 
 
149 aa  293  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0536818  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1737  hypothetical protein  54.55 
 
 
157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1713  Ion transport protein  51.01 
 
 
149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0380308  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2914  Ion transport 2 domain-containing protein  44.29 
 
 
136 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2745  Ion transport 2 domain-containing protein  41.67 
 
 
138 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2823  Ion transport 2 domain-containing protein  41.67 
 
 
138 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  40.85 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  35 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  35 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  36.11 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  41.57 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  49.25 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  39.78 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4033  hypothetical protein  37.37 
 
 
154 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  29.69 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0877  hypothetical protein  36.76 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  29.08 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  41.82 
 
 
202 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  39.66 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4133  hypothetical protein  26.92 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4979  hypothetical protein  35.38 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4684  hypothetical protein  35.38 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0831777  normal  0.858819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4596  hypothetical protein  35.38 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  32.38 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3124  ion transport 2 domain-containing protein  27.63 
 
 
150 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>