35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1179 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  100 
 
 		 147 aa  295  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  37.84 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1713  Ion transport protein  30.3 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0380308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  36.54 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  42.31 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1737  hypothetical protein  29.17 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  30.71 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2745  Ion transport 2 domain-containing protein  30.23 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2823  Ion transport 2 domain-containing protein  30.23 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  34.83 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2914  Ion transport 2 domain-containing protein  28.91 
 
 		 136 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44180  voltage-dependent potassium channel  38.24 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0536818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  33.09 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  29.71 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  39.66 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  29.6 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  28.24 
 
 		 172 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0962  Ion transport 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.318129  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  43.1 
 
 		 231 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  42.31 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4979  hypothetical protein  42.86 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4684  hypothetical protein  42.86 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0831777  normal  0.858819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4596  hypothetical protein  42.86 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4033  hypothetical protein  29.25 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  25.38 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1358  hypothetical protein  22.56 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.250908  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 361 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3124  ion transport 2 domain-containing protein  33.8 
 
 		 150 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  39.29 
 
 		 517 aa  41.2  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  29.2 
 
 		 222 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0395  membrane protein related to Kef-type K+ transport system NAD-binding component  40.82 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.855451  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0591  hypothetical protein  26.19 
 
 		 170 aa  40.4  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  40.74 
 
 		 227 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_3676  predicted protein  36.67 
 
 		 277 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>