36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2797 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 
145 aa  283  8e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  47.37 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  43.61 
 
 
142 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1713  Ion transport protein  44 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0380308  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  36.8 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44180  voltage-dependent potassium channel  52.05 
 
 
149 aa  72  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0536818  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2914  Ion transport 2 domain-containing protein  30.4 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1737  hypothetical protein  45.33 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372846  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  36.11 
 
 
148 aa  67  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2745  Ion transport 2 domain-containing protein  36.14 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2823  Ion transport 2 domain-containing protein  36.14 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0877  hypothetical protein  32.79 
 
 
175 aa  62  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  41.77 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4033  hypothetical protein  42.47 
 
 
154 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  30.99 
 
 
161 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  28.8 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4684  hypothetical protein  34.29 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0831777  normal  0.858819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4979  hypothetical protein  34.29 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4596  hypothetical protein  34.29 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  25.35 
 
 
172 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  32.04 
 
 
160 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  33.09 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  28.7 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  27.78 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  28.79 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  29.31 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  25.35 
 
 
361 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4133  hypothetical protein  35.24 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  28.79 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  29.91 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  38.18 
 
 
202 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5595  Kef-type K+ transport system-like protein  31.11 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734625  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  27.27 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3124  ion transport 2 domain-containing protein  29.49 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1933  hypothetical protein  27.27 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>