24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1933 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1933  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  207  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  40 
 
 		 361 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  35.63 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  36.26 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  28.83 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  38.75 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  38.75 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  33.7 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  29 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  35.56 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0395  membrane protein related to Kef-type K+ transport system NAD-binding component  29.41 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.855451  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3770  ion transport 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.541985 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4046  ion transport 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205691  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5595  Kef-type K+ transport system-like protein  24.73 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1309  Ion transport 2  33.33 
 
 		 331 aa  40.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.1844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0306  Ion transport 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.408069  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  24.75 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  29.31 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>