38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1961 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  100 
 
 		 160 aa  326  6e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  46.1 
 
 		 361 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  43.87 
 
 		 172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  44.06 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  41.84 
 
 		 143 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  33.78 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  43.41 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  39.53 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  36.69 
 
 		 141 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  42.31 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  40.32 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  37.7 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5595  Kef-type K+ transport system-like protein  33.33 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0306  Ion transport 2 domain-containing protein  34.75 
 
 		 148 aa  88.6  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.408069  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0075  membrane protein, Kef-type K+ transport system NAD-binding component  38.39 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0395  membrane protein related to Kef-type K+ transport system NAD-binding component  31.97 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.855451  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  30.52 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1933  hypothetical protein  36.26 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  34.41 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  32.97 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  31.76 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3124  ion transport 2 domain-containing protein  37.97 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  32.04 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  29.71 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  32.69 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44180  voltage-dependent potassium channel  31.91 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0536818  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  32.29 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0877  hypothetical protein  25.53 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1713  Ion transport protein  25.35 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0380308  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0442  LCTB protein, potassium channel  27.27 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0503  potassium channel protein  27.27 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0535  potassium channel protein  27.27 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0211593  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0518  putative potassium channel protein  27.27 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000436021 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4046  ion transport 2 domain-containing protein  34.85 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205691  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3770  ion transport 2 domain-containing protein  34.85 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.541985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0540  putative potassium channel protein  31.17 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4786  putative potassium channel protein  31.17 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0423111  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>