51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3025 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  90.07 
 
 		 141 aa  265  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  87.94 
 
 		 141 aa  258  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  73.19 
 
 		 149 aa  217  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  60.16 
 
 		 129 aa  168  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0306  Ion transport 2 domain-containing protein  56.74 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.408069  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  37.88 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  35.25 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  38.85 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  40 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  36.76 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  37.41 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  36.69 
 
 		 361 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5595  Kef-type K+ transport system-like protein  34.59 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0075  membrane protein, Kef-type K+ transport system NAD-binding component  36.19 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0395  membrane protein related to Kef-type K+ transport system NAD-binding component  35.61 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.855451  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1933  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  29.55 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  29.59 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  29.9 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  37.7 
 
 		 276 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  31.11 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  39.29 
 
 		 271 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  50 
 
 		 263 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  37.5 
 
 		 269 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2957  Ion transport 2 domain protein  29.1 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00024289  hitchhiker  0.0035902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  31.73 
 
 		 311 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3124  ion transport 2 domain-containing protein  36.96 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  32.58 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3770  ion transport 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.541985 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4046  ion transport 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0372  Ion transport 2 domain protein  37.5 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.606309 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31611  VIC family transporter: potassium ion channel subfamily H  33.03 
 
 		 472 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0596506  hitchhiker  0.00581537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  43.24 
 
 		 327 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2914  Ion transport 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0050  Ion transport 2 domain protein  26.06 
 
 		 372 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  30.59 
 
 		 564 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0755  Ion transport 2 domain-containing protein  35.85 
 
 		 330 aa  41.6  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  41.82 
 
 		 341 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  47.62 
 
 		 268 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  40.54 
 
 		 327 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  39.02 
 
 		 326 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0848  TrkA-N  48.72 
 
 		 347 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0423628  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  40.54 
 
 		 327 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  37.88 
 
 		 234 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  38.46 
 
 		 222 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1163  Ion transport 2 domain protein  34.18 
 
 		 247 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4033  hypothetical protein  28.17 
 
 		 154 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>