43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2957 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2957  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 		 190 aa  367  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00024289  hitchhiker  0.0035902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4491  Ion transport 2 domain protein  36.65 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1491  Ion transport 2 domain protein  41.36 
 
 		 169 aa  96.3  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0538744  normal  0.996419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5619  Ion transport 2 domain-containing protein  33.6 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00971652  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  39.13 
 
 		 294 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  36.05 
 
 		 141 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  37.04 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  27.18 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  32.26 
 
 		 143 aa  45.1  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  34.74 
 
 		 302 aa  44.7  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  34.74 
 
 		 303 aa  44.7  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  27.03 
 
 		 269 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  30.59 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  30.19 
 
 		 278 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  30.19 
 
 		 278 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  30.19 
 
 		 278 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  29.79 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  30.19 
 
 		 278 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1173  Ion transport 2 domain-containing protein  39.76 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  31.1 
 
 		 391 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  30.11 
 
 		 269 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  40 
 
 		 438 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  30.19 
 
 		 278 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  40 
 
 		 408 aa  42.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  30.99 
 
 		 280 aa  42.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  32.53 
 
 		 271 aa  42.4  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  36.84 
 
 		 305 aa  42.4  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1249  Ion transport 2 domain protein  27.97 
 
 		 249 aa  42.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  28.7 
 
 		 310 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  28.26 
 
 		 517 aa  42  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  35.48 
 
 		 222 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1106  Ion transport 2 domain-containing protein  27.97 
 
 		 256 aa  41.6  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0650  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  28.77 
 
 		 304 aa  41.6  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  33.33 
 
 		 391 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  31.96 
 
 		 454 aa  41.6  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  28.7 
 
 		 285 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6042  Ion transport 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 256 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  37.5 
 
 		 311 aa  41.2  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  25.24 
 
 		 273 aa  41.2  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 276 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  35.94 
 
 		 356 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41686  VIC family transporter: inwardly rectifying potassium ion channel  41.67 
 
 		 648 aa  41.2  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0173475  decreased coverage  0.000449346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>