40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0650 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0650  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  100 
 
 
304 aa  629  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2912  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  43.73 
 
 
307 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3184  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  43.73 
 
 
307 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.203496  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0588  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  44.57 
 
 
323 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  45.21 
 
 
303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  41.6 
 
 
311 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3890  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  40.56 
 
 
320 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112226  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4204  K+ channel, inward rectifier, region 2  40.23 
 
 
299 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  34.72 
 
 
752 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0311  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  37.89 
 
 
326 aa  175  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434618  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4289  putative inward rectifier potassium channel  37.37 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0420  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  37.72 
 
 
319 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  37.02 
 
 
304 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  33.33 
 
 
288 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0376  inward rectifier potassium channel  37.22 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0395  inward rectifier potassium channel  37.22 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0562  inward rectifier potassium channel  37.22 
 
 
520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.926063  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2991  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  38.43 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0665  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  35.25 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0276216  normal  0.0192333 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0341  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  37.6 
 
 
305 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.496756 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2854  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  38.66 
 
 
293 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0327  potassium channel protein  35.77 
 
 
532 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2965  Ion transport 2 domain-containing protein  39.1 
 
 
322 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6296  K+ channel, inward rectifier  38.35 
 
 
320 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2944  Ion transport 2 domain-containing protein  39.1 
 
 
322 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2330  K+ channel, inward rectifier, region 2  39.1 
 
 
322 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0632805  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0326  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  37.11 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  35.88 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  35.38 
 
 
307 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  34.31 
 
 
311 aa  149  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4333  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  32.2 
 
 
299 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4338  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  30.74 
 
 
305 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4316  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  30.74 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4185  K+ channel, inward rectifier  30.56 
 
 
305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0210  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  29.82 
 
 
330 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  0.97527 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49496  predicted protein  27.33 
 
 
526 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42996  predicted protein  25.27 
 
 
684 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.578593  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1173  Ion transport 2 domain-containing protein  29.75 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44434  predicted protein  23.85 
 
 
430 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.497983  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  29.47 
 
 
517 aa  42.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>