40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0311 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0311  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  100 
 
 
326 aa  670    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434618  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0665  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  48.25 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0276216  normal  0.0192333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  41.26 
 
 
303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3184  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  40.07 
 
 
307 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.203496  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2912  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  40.07 
 
 
307 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  39.34 
 
 
304 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4204  K+ channel, inward rectifier, region 2  40.51 
 
 
299 aa  205  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3890  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  39.78 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112226  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0588  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  40.15 
 
 
323 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  37.88 
 
 
311 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  37.59 
 
 
313 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0420  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  36.36 
 
 
319 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4289  putative inward rectifier potassium channel  37.45 
 
 
323 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0376  inward rectifier potassium channel  36.46 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0562  inward rectifier potassium channel  36.46 
 
 
520 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.926063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0395  inward rectifier potassium channel  36.46 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2991  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  35.49 
 
 
321 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6296  K+ channel, inward rectifier  35.96 
 
 
320 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2965  Ion transport 2 domain-containing protein  36.71 
 
 
322 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2944  Ion transport 2 domain-containing protein  36.71 
 
 
322 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2330  K+ channel, inward rectifier, region 2  36.71 
 
 
322 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0632805  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2854  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  35.69 
 
 
293 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0650  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  37.89 
 
 
304 aa  175  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0327  potassium channel protein  34.88 
 
 
532 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  32.75 
 
 
752 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  34.75 
 
 
288 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0341  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  34.7 
 
 
305 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.496756 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  34.27 
 
 
307 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0326  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  35 
 
 
305 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0210  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  27.24 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  0.97527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  30.94 
 
 
311 aa  125  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4333  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  30.31 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4316  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  36.63 
 
 
305 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4338  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  29.14 
 
 
305 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4185  K+ channel, inward rectifier  35.47 
 
 
305 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44434  predicted protein  27.27 
 
 
430 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.497983  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  40.35 
 
 
256 aa  47.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49496  predicted protein  35.56 
 
 
526 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  28.42 
 
 
222 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43651  predicted protein  23.08 
 
 
520 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>