39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4204 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4204  K+ channel, inward rectifier, region 2  100 
 
 
299 aa  612  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3184  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  55.64 
 
 
307 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.203496  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2912  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  55.64 
 
 
307 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  50.83 
 
 
303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0588  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  51.44 
 
 
323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  45.99 
 
 
311 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3890  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  48.14 
 
 
320 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112226  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4289  putative inward rectifier potassium channel  43.14 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0327  potassium channel protein  41.7 
 
 
532 aa  252  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0562  inward rectifier potassium channel  40.4 
 
 
520 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.926063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0376  inward rectifier potassium channel  40.4 
 
 
333 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0395  inward rectifier potassium channel  40.4 
 
 
333 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0420  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  41.67 
 
 
319 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  45.13 
 
 
313 aa  242  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  45.45 
 
 
288 aa  239  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2991  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  42.23 
 
 
321 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  40.33 
 
 
307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2965  Ion transport 2 domain-containing protein  41.89 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2944  Ion transport 2 domain-containing protein  41.89 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2330  K+ channel, inward rectifier, region 2  41.89 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0632805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6296  K+ channel, inward rectifier  41.89 
 
 
320 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0341  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  42.4 
 
 
305 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.496756 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2854  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  43.75 
 
 
293 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  38.31 
 
 
304 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0326  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  41.7 
 
 
305 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  42.65 
 
 
752 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0311  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  40.51 
 
 
326 aa  205  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434618  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0650  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  40.23 
 
 
304 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0665  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  40.46 
 
 
317 aa  202  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0276216  normal  0.0192333 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  36.68 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0210  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  33.33 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  0.97527 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4338  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  32.7 
 
 
305 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4316  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  32.7 
 
 
305 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4333  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  29.59 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4185  K+ channel, inward rectifier  31.46 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49496  predicted protein  23.99 
 
 
526 aa  63.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 
256 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44434  predicted protein  24.87 
 
 
430 aa  46.6  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.497983  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  25.81 
 
 
430 aa  45.8  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>