74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2854 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2854  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  100 
 
 		 293 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2991  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  98.63 
 
 		 321 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6296  K+ channel, inward rectifier  90.48 
 
 		 320 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2944  Ion transport 2 domain-containing protein  89.64 
 
 		 322 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2965  Ion transport 2 domain-containing protein  89.64 
 
 		 322 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2330  K+ channel, inward rectifier, region 2  89.64 
 
 		 322 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0632805  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0327  potassium channel protein  77.24 
 
 		 532 aa  424  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0562  inward rectifier potassium channel  76.12 
 
 		 520 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.926063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0376  inward rectifier potassium channel  76.12 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0395  inward rectifier potassium channel  76.12 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  69.78 
 
 		 313 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4289  putative inward rectifier potassium channel  69.03 
 
 		 323 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0420  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  69.96 
 
 		 319 aa  401  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  74.82 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0341  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  73.51 
 
 		 305 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.496756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0326  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  73.88 
 
 		 305 aa  377  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  50 
 
 		 303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0588  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  46.21 
 
 		 323 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2912  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  46.56 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3184  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  46.56 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.203496  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3890  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  45.9 
 
 		 320 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4204  K+ channel, inward rectifier, region 2  43.75 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  43.56 
 
 		 311 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  41.85 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  40.38 
 
 		 288 aa  216  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0665  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  43.24 
 
 		 317 aa  202  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0276216  normal  0.0192333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0311  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  36.62 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434618  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  38.46 
 
 		 752 aa  181  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  37.93 
 
 		 311 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0650  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  38.66 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0210  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  32.78 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  0.97527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4333  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  34.22 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4338  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  32.32 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4316  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  32.82 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4185  K+ channel, inward rectifier  31.84 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49496  predicted protein  23.04 
 
 		 526 aa  59.3  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  38.2 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0050  Ion transport 2 domain protein  30.4 
 
 		 372 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  32.29 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  30.77 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  30.77 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  30.77 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  30.77 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  27.37 
 
 		 299 aa  45.8  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  33.33 
 
 		 279 aa  45.8  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  36.51 
 
 		 569 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  34.57 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  30.67 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  42.31 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  35.35 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  23.77 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  24.17 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  28.57 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  28.57 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  28.57 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  28.57 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  27.66 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  28.57 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  34.88 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  28.42 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  34.34 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  27.55 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  34.78 
 
 		 336 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  33.33 
 
 		 276 aa  43.1  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  27.78 
 
 		 277 aa  43.1  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  29.29 
 
 		 276 aa  43.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  30.23 
 
 		 430 aa  43.1  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  32.56 
 
 		 364 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  35.85 
 
 		 258 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  36.36 
 
 		 272 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  25.77 
 
 		 279 aa  42.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  32.18 
 
 		 231 aa  42.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  32.05 
 
 		 272 aa  42.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  37.04 
 
 		 272 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>