94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0420 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0420  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  100 
 
 
319 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4289  putative inward rectifier potassium channel  86.77 
 
 
323 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  66.33 
 
 
313 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0395  inward rectifier potassium channel  63.18 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0562  inward rectifier potassium channel  63.18 
 
 
520 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.926063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0376  inward rectifier potassium channel  63.18 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0327  potassium channel protein  63.99 
 
 
532 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2965  Ion transport 2 domain-containing protein  66.89 
 
 
322 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6296  K+ channel, inward rectifier  66.55 
 
 
320 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2944  Ion transport 2 domain-containing protein  66.89 
 
 
322 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2330  K+ channel, inward rectifier, region 2  66.89 
 
 
322 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0632805  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2991  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  65.2 
 
 
321 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2854  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  69.96 
 
 
293 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  61.62 
 
 
307 aa  360  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0341  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  60.79 
 
 
305 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.496756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0326  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  61.51 
 
 
305 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  45.82 
 
 
303 aa  259  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3184  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  43.42 
 
 
307 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.203496  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2912  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  43.42 
 
 
307 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4204  K+ channel, inward rectifier, region 2  41.67 
 
 
299 aa  245  8e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0588  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  43.45 
 
 
323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  40.07 
 
 
304 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3890  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  43.73 
 
 
320 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112226  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  41.29 
 
 
311 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  41.39 
 
 
288 aa  208  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0665  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  39.18 
 
 
317 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0276216  normal  0.0192333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0311  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  36.36 
 
 
326 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434618  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  37.69 
 
 
752 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  35.19 
 
 
311 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0650  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  37.72 
 
 
304 aa  169  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0210  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  33.85 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  0.97527 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4338  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  30.11 
 
 
305 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4333  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  29.28 
 
 
299 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4316  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  30.11 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4185  K+ channel, inward rectifier  31.46 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49496  predicted protein  21.62 
 
 
526 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0050  Ion transport 2 domain protein  30.08 
 
 
372 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  37.08 
 
 
256 aa  53.5  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  35.56 
 
 
282 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  37.76 
 
 
276 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  33.33 
 
 
295 aa  49.7  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  32.58 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  36.73 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  32.63 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  33.71 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  31.58 
 
 
367 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  36.67 
 
 
284 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  29.9 
 
 
275 aa  47  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  37.5 
 
 
279 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  33.67 
 
 
276 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  30.85 
 
 
279 aa  46.2  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  32.94 
 
 
306 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  28.89 
 
 
282 aa  45.8  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  36.36 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  38.46 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  30.12 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  31.11 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  31.11 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  31.11 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  31.11 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  31.11 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  31.37 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  31.11 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  32.53 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  32.22 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  25.98 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  25.98 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  31.82 
 
 
287 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  31.11 
 
 
284 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  30.59 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30350  potassium channel  47.73 
 
 
106 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  35.19 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  32.53 
 
 
264 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  30.59 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  31.37 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44434  predicted protein  26.19 
 
 
430 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.497983  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  33.96 
 
 
258 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  28.72 
 
 
279 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  34.94 
 
 
295 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  30 
 
 
277 aa  43.5  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  30.93 
 
 
278 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  30.93 
 
 
278 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  34.48 
 
 
264 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  30.93 
 
 
278 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  30.93 
 
 
278 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  33.33 
 
 
231 aa  43.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  30.93 
 
 
278 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  32.97 
 
 
253 aa  42.7  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  32.97 
 
 
283 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  34.62 
 
 
310 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  25 
 
 
347 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46341  predicted protein  29.63 
 
 
948 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 
253 aa  42.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  31.58 
 
 
271 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>