163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_30350 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_30350  potassium channel  100 
 
 		 106 aa  215  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  71.95 
 
 		 273 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  71.95 
 
 		 273 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  71.95 
 
 		 273 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  71.95 
 
 		 274 aa  127  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  68.67 
 
 		 274 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  69.51 
 
 		 277 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  70.59 
 
 		 283 aa  123  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  59.57 
 
 		 284 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  65.88 
 
 		 277 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  69.41 
 
 		 283 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  69.62 
 
 		 276 aa  115  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  68.35 
 
 		 276 aa  113  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  67.09 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  55.7 
 
 		 276 aa  100  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  53.16 
 
 		 287 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  66.25 
 
 		 279 aa  98.6  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  55.7 
 
 		 276 aa  99.4  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  50.63 
 
 		 278 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  50.63 
 
 		 278 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  50.63 
 
 		 278 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  50.63 
 
 		 278 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  50.63 
 
 		 278 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  45.92 
 
 		 295 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  53.16 
 
 		 295 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  51.9 
 
 		 275 aa  94.4  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  55.26 
 
 		 289 aa  94.4  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  53.85 
 
 		 298 aa  94  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  53.95 
 
 		 284 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  53.95 
 
 		 284 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  53.95 
 
 		 284 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  50.63 
 
 		 282 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  53.95 
 
 		 284 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  51.9 
 
 		 279 aa  92  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  50.56 
 
 		 282 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  52.63 
 
 		 289 aa  92  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  52.63 
 
 		 289 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  52.63 
 
 		 289 aa  92  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  56.96 
 
 		 272 aa  91.3  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  48.1 
 
 		 289 aa  90.9  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  51.9 
 
 		 277 aa  90.5  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  50.63 
 
 		 279 aa  90.1  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  51.9 
 
 		 280 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  54.43 
 
 		 273 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  49.37 
 
 		 288 aa  88.2  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  52.5 
 
 		 307 aa  87.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  50.62 
 
 		 290 aa  87  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  46.25 
 
 		 271 aa  85.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  50 
 
 		 279 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  50.63 
 
 		 276 aa  84.3  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  53.16 
 
 		 272 aa  84  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  51.25 
 
 		 306 aa  83.6  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  48.75 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  46.67 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  42.55 
 
 		 303 aa  80.5  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  42.71 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  48.81 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  42.71 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  46.34 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  47.56 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  39.78 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  38.54 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  42.86 
 
 		 290 aa  72  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  40.96 
 
 		 275 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  46.15 
 
 		 273 aa  70.5  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  41.77 
 
 		 282 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  44.44 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  43.75 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  43.75 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  52.38 
 
 		 258 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  39.24 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  35.8 
 
 		 282 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  43.9 
 
 		 283 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  56.82 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  46.27 
 
 		 267 aa  57.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  42.5 
 
 		 285 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  35.44 
 
 		 263 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  42.03 
 
 		 269 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  43.08 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1814  Ion transport 2 domain-containing protein  37.18 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176499 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  42.65 
 
 		 269 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  43.55 
 
 		 269 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  43.08 
 
 		 265 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  35.29 
 
 		 256 aa  52.4  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  38.36 
 
 		 273 aa  51.6  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  36.11 
 
 		 212 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1249  Ion transport 2 domain protein  34.62 
 
 		 249 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1106  Ion transport 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 256 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  44.44 
 
 		 331 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6042  Ion transport 2 domain-containing protein  35.9 
 
 		 256 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  37.35 
 
 		 325 aa  50.4  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4869  Ion transport 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 271 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5039  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 256 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.103655 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  37.35 
 
 		 325 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  31.43 
 
 		 277 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  38.71 
 
 		 231 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4579  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 256 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  32.91 
 
 		 269 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  44.12 
 
 		 302 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  40 
 
 		 357 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>