39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2009 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  100 
 
 
311 aa  641    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  54.58 
 
 
303 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0588  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  48.36 
 
 
323 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3184  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  46.55 
 
 
307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.203496  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2912  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  46.55 
 
 
307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4204  K+ channel, inward rectifier, region 2  45.99 
 
 
299 aa  269  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3890  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  48.29 
 
 
320 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112226  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  43.18 
 
 
313 aa  231  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0395  inward rectifier potassium channel  43.18 
 
 
333 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0376  inward rectifier potassium channel  43.18 
 
 
333 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0562  inward rectifier potassium channel  43.18 
 
 
520 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.926063  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  42.8 
 
 
288 aa  226  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2991  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  43.94 
 
 
321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2854  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  43.56 
 
 
293 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0420  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  41.29 
 
 
319 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4289  putative inward rectifier potassium channel  41.48 
 
 
323 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0327  potassium channel protein  41.85 
 
 
532 aa  222  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2330  K+ channel, inward rectifier, region 2  43.77 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0632805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2965  Ion transport 2 domain-containing protein  43.77 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2944  Ion transport 2 domain-containing protein  43.77 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0341  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  42.05 
 
 
305 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.496756 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6296  K+ channel, inward rectifier  42.42 
 
 
320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0650  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  41.6 
 
 
304 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0326  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  41.67 
 
 
305 aa  208  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  39.77 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  41.38 
 
 
752 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0665  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  37.91 
 
 
317 aa  193  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0276216  normal  0.0192333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0311  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  37.88 
 
 
326 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434618  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  33.79 
 
 
304 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0210  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  37.12 
 
 
330 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  0.97527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  37.08 
 
 
311 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4333  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  31.67 
 
 
299 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4316  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  39.33 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4338  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  32.26 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4185  K+ channel, inward rectifier  31.41 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49496  predicted protein  22.32 
 
 
526 aa  62.4  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0372  Ion transport 2 domain protein  38.46 
 
 
190 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.606309 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43651  predicted protein  29.36 
 
 
520 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  26.8 
 
 
256 aa  43.5  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>