83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2113 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  100 
 
 		 304 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0376  inward rectifier potassium channel  43.15 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0395  inward rectifier potassium channel  43.15 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0562  inward rectifier potassium channel  43.15 
 
 		 520 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.926063  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  43.77 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0327  potassium channel protein  42.51 
 
 		 532 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0341  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  42.4 
 
 		 305 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.496756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4289  putative inward rectifier potassium channel  40.41 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  42.41 
 
 		 307 aa  237  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  39.31 
 
 		 303 aa  231  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0420  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  40.07 
 
 		 319 aa  228  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4204  K+ channel, inward rectifier, region 2  38.31 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0326  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  42.5 
 
 		 305 aa  225  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2965  Ion transport 2 domain-containing protein  40.89 
 
 		 322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2944  Ion transport 2 domain-containing protein  40.89 
 
 		 322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2330  K+ channel, inward rectifier, region 2  40.89 
 
 		 322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0632805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0588  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  42.08 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3184  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  42.75 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.203496  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2912  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  42.75 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6296  K+ channel, inward rectifier  40.55 
 
 		 320 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2991  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  39.93 
 
 		 321 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2854  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  41.85 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3890  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  39.47 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0311  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  39.34 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434618  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  37.55 
 
 		 288 aa  208  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0665  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  37.16 
 
 		 317 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0276216  normal  0.0192333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  33.79 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  37.87 
 
 		 752 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0650  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  37.02 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  30.8 
 
 		 311 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0210  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  27.15 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  0.97527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4333  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  30.58 
 
 		 299 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4338  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  29.89 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4316  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  30.6 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4185  K+ channel, inward rectifier  30.6 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  26.21 
 
 		 257 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  42 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  26.67 
 
 		 272 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  26.04 
 
 		 385 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  31.15 
 
 		 260 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  39.22 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  37.04 
 
 		 279 aa  46.2  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  26.43 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  33.33 
 
 		 272 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  45.45 
 
 		 128 aa  45.8  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  31.17 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  32.79 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  37.74 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.93 
 
 		 408 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  26.61 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  38 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  32.73 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  29.09 
 
 		 531 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0050  Ion transport 2 domain protein  29.25 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  37.5 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  30.33 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  26.19 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  30.33 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  27.59 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  36.36 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  34.43 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1183  Ion transport 2 domain protein  38.27 
 
 		 126 aa  43.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.993846  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  40 
 
 		 276 aa  43.5  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  37.04 
 
 		 276 aa  43.1  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0760  Ion transport 2 domain protein  34.62 
 
 		 224 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1097  Ion transport 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 140 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168795  normal  0.504261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  29.59 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  28.99 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  33.33 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  29.59 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  27.72 
 
 		 335 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  40 
 
 		 276 aa  42.7  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  31.48 
 
 		 271 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  26.73 
 
 		 346 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  29.82 
 
 		 276 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  35.71 
 
 		 419 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  38.78 
 
 		 279 aa  42.4  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  25.23 
 
 		 271 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  29.87 
 
 		 335 aa  42.4  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  25 
 
 		 269 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  26.97 
 
 		 295 aa  42.4  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>