53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0210 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0210  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  100 
 
 		 330 aa  684    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  0.97527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  41.35 
 
 		 311 aa  249  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2912  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  38.01 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3184  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  38.01 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.203496  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3890  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  39.18 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0588  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  35.36 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  37.12 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  34.01 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  32.95 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4289  putative inward rectifier potassium channel  33.45 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4204  K+ channel, inward rectifier, region 2  33.33 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  29.52 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0665  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  31.42 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0276216  normal  0.0192333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0420  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  33.85 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0376  inward rectifier potassium channel  29.55 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0395  inward rectifier potassium channel  29.55 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0562  inward rectifier potassium channel  30.45 
 
 		 520 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.926063  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0341  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  33.61 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.496756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2991  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  33.2 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2854  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  32.78 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2944  Ion transport 2 domain-containing protein  33.05 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2330  K+ channel, inward rectifier, region 2  33.05 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0632805  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0327  potassium channel protein  30.08 
 
 		 532 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6296  K+ channel, inward rectifier  32.37 
 
 		 320 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2965  Ion transport 2 domain-containing protein  33.05 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0326  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  32.78 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0311  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  27.24 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434618  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  31.95 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  27.15 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0650  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  29.82 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  28.2 
 
 		 752 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4333  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  33.33 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4338  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  27.21 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4316  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  27.57 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4185  K+ channel, inward rectifier  27.14 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  35.71 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  35.71 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  35.71 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  35.71 
 
 		 284 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  34.15 
 
 		 289 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  34.52 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  32.14 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  34.52 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  30.99 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  34.52 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  33.33 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  25.83 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  31.75 
 
 		 268 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  28.7 
 
 		 277 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  29.58 
 
 		 265 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  30.38 
 
 		 279 aa  43.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  28 
 
 		 212 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10571  potassium channel, VIC family protein  35.71 
 
 		 259 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>