75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0341 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0341  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  100 
 
 		 305 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.496756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0326  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  95.41 
 
 		 305 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  81.16 
 
 		 307 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0395  inward rectifier potassium channel  68.71 
 
 		 333 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0376  inward rectifier potassium channel  68.71 
 
 		 333 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0562  inward rectifier potassium channel  68.71 
 
 		 520 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.926063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0327  potassium channel protein  69.69 
 
 		 532 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2991  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  70.76 
 
 		 321 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6296  K+ channel, inward rectifier  70.75 
 
 		 320 aa  407  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2965  Ion transport 2 domain-containing protein  68.98 
 
 		 322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2944  Ion transport 2 domain-containing protein  68.98 
 
 		 322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2330  K+ channel, inward rectifier, region 2  68.98 
 
 		 322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0632805  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2854  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  73.51 
 
 		 293 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  62.13 
 
 		 313 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4289  putative inward rectifier potassium channel  60.55 
 
 		 323 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0420  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  60.79 
 
 		 319 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  45.89 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  42.4 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3890  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  46.15 
 
 		 320 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0588  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  42.42 
 
 		 323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4204  K+ channel, inward rectifier, region 2  42.4 
 
 		 299 aa  235  6e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3184  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  45.63 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.203496  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2912  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  45.63 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  42.05 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  41.09 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0665  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  40.29 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0276216  normal  0.0192333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  37.31 
 
 		 752 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  35.53 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0311  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  34.7 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434618  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0650  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  37.6 
 
 		 304 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0210  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  33.61 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  0.97527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4333  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  30.8 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4338  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  27.11 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4316  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  28.52 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4185  K+ channel, inward rectifier  29.27 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  37.89 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49496  predicted protein  21.7 
 
 		 526 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  35.58 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  36.36 
 
 		 438 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  37.5 
 
 		 408 aa  49.7  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0050  Ion transport 2 domain protein  30.95 
 
 		 372 aa  49.3  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  29.49 
 
 		 569 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1183  Ion transport 2 domain protein  42.11 
 
 		 126 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.993846  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  42.11 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  40.38 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  41.18 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  40.74 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  37.5 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  29.91 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  45.1 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  37.74 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  31.25 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  34.43 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  30.84 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  40.54 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  32.84 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  38.18 
 
 		 272 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  35.19 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  36.36 
 
 		 273 aa  43.5  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  43.18 
 
 		 278 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  43.18 
 
 		 278 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  43.18 
 
 		 278 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  43.18 
 
 		 278 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  43.18 
 
 		 278 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  38.46 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  42.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  36.54 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  34.43 
 
 		 264 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  39.19 
 
 		 276 aa  42.7  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  35.09 
 
 		 272 aa  42.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  33 
 
 		 289 aa  42.7  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  40.74 
 
 		 272 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  50 
 
 		 128 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  26.67 
 
 		 253 aa  42.7  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42996  predicted protein  24.22 
 
 		 684 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.578593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>