31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49496 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49496  predicted protein  100 
 
 
526 aa  1097    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44434  predicted protein  22.58 
 
 
430 aa  91.3  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.497983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  24.05 
 
 
303 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4289  putative inward rectifier potassium channel  22.59 
 
 
323 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4204  K+ channel, inward rectifier, region 2  23.99 
 
 
299 aa  63.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0327  potassium channel protein  20.89 
 
 
532 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3184  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  22.39 
 
 
307 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.203496  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0420  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  21.62 
 
 
319 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  23.65 
 
 
313 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  22.32 
 
 
311 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2912  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  22.39 
 
 
307 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0588  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  23.12 
 
 
323 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3890  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  31.17 
 
 
320 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112226  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0665  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  25.91 
 
 
317 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0276216  normal  0.0192333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2991  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  21.52 
 
 
321 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0562  inward rectifier potassium channel  21.88 
 
 
520 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.926063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0395  inward rectifier potassium channel  21.88 
 
 
333 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0376  inward rectifier potassium channel  21.88 
 
 
333 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2854  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  21.88 
 
 
293 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  23.72 
 
 
311 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  22.01 
 
 
288 aa  56.2  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  28.16 
 
 
752 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2965  Ion transport 2 domain-containing protein  20.94 
 
 
322 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2944  Ion transport 2 domain-containing protein  20.94 
 
 
322 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2330  K+ channel, inward rectifier, region 2  20.94 
 
 
322 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0632805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6296  K+ channel, inward rectifier  20.57 
 
 
320 aa  54.7  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  23.28 
 
 
307 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0341  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  27.27 
 
 
305 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.496756 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0650  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  27.33 
 
 
304 aa  47.8  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0326  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  29.63 
 
 
305 aa  47.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0311  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  35.56 
 
 
326 aa  46.6  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434618  normal  0.120793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>