84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0395 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0376  inward rectifier potassium channel  100 
 
 
333 aa  685    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0395  inward rectifier potassium channel  100 
 
 
333 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0562  inward rectifier potassium channel  100 
 
 
520 aa  693    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.926063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0327  potassium channel protein  88.53 
 
 
532 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2944  Ion transport 2 domain-containing protein  75.16 
 
 
322 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2965  Ion transport 2 domain-containing protein  75.16 
 
 
322 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2330  K+ channel, inward rectifier, region 2  75.16 
 
 
322 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0632805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6296  K+ channel, inward rectifier  71.08 
 
 
320 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2991  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  72.03 
 
 
321 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  68.9 
 
 
313 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0341  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  67.66 
 
 
305 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.496756 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  71.38 
 
 
307 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4289  putative inward rectifier potassium channel  62.26 
 
 
323 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0420  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  63.18 
 
 
319 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2854  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  76.12 
 
 
293 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0326  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  70 
 
 
305 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  44.03 
 
 
303 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  43.15 
 
 
304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4204  K+ channel, inward rectifier, region 2  40.27 
 
 
299 aa  249  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0588  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  44.53 
 
 
323 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2912  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  45.25 
 
 
307 aa  238  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3184  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  45.25 
 
 
307 aa  238  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.203496  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3890  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  41.14 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112226  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  43.18 
 
 
311 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  38.93 
 
 
288 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  37.29 
 
 
752 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0665  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  41.09 
 
 
317 aa  195  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0276216  normal  0.0192333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0311  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  35.79 
 
 
326 aa  186  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434618  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  34.32 
 
 
311 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0650  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  37.22 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0210  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  29.55 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  0.97527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4333  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  30.83 
 
 
299 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4338  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  29.03 
 
 
305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4316  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  30.11 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4185  K+ channel, inward rectifier  30.47 
 
 
305 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49496  predicted protein  21.88 
 
 
526 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0050  Ion transport 2 domain protein  28.97 
 
 
372 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  36.36 
 
 
256 aa  50.4  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  27.19 
 
 
569 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  26.95 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  27.14 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  37.86 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  32.22 
 
 
295 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  36.56 
 
 
276 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  32.04 
 
 
273 aa  47  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  31.46 
 
 
282 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  35.29 
 
 
306 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  29.47 
 
 
263 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  42.59 
 
 
279 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  29.79 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30350  potassium channel  50 
 
 
106 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  38.6 
 
 
276 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  32.61 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  30.34 
 
 
276 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  31.82 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  40.38 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  30.59 
 
 
272 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  40.38 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  40 
 
 
272 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  29.55 
 
 
282 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  32.94 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  31.78 
 
 
289 aa  43.9  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  35.96 
 
 
284 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  30.84 
 
 
289 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  30.84 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  30.84 
 
 
289 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  35.85 
 
 
258 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  34.34 
 
 
273 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  33.33 
 
 
284 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  33.33 
 
 
284 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  33.33 
 
 
284 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  34.33 
 
 
284 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  31.58 
 
 
438 aa  43.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  28.42 
 
 
289 aa  43.1  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  34.83 
 
 
283 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  34.62 
 
 
303 aa  43.1  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  31.58 
 
 
408 aa  42.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  41.3 
 
 
280 aa  42.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  52.38 
 
 
128 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  30.85 
 
 
279 aa  42.7  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  34.83 
 
 
283 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  28.35 
 
 
241 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  35.19 
 
 
299 aa  42.4  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  32.22 
 
 
277 aa  42.4  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>