90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0588 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0588  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  100 
 
 
323 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2912  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  66.91 
 
 
307 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3184  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  66.91 
 
 
307 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.203496  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  55.3 
 
 
303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4204  K+ channel, inward rectifier, region 2  51.44 
 
 
299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3890  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  55.73 
 
 
320 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112226  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  48.36 
 
 
311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  46.04 
 
 
313 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0562  inward rectifier potassium channel  44.53 
 
 
520 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.926063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0395  inward rectifier potassium channel  44.53 
 
 
333 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0376  inward rectifier potassium channel  44.53 
 
 
333 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4289  putative inward rectifier potassium channel  44.19 
 
 
323 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0327  potassium channel protein  44.15 
 
 
532 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  43.58 
 
 
288 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2854  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  46.21 
 
 
293 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2991  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  45.83 
 
 
321 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0420  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  43.45 
 
 
319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6296  K+ channel, inward rectifier  44.4 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2965  Ion transport 2 domain-containing protein  44.32 
 
 
322 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2944  Ion transport 2 domain-containing protein  44.32 
 
 
322 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2330  K+ channel, inward rectifier, region 2  44.32 
 
 
322 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0632805  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0650  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  44.57 
 
 
304 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0341  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  42.42 
 
 
305 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.496756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0326  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  42.8 
 
 
305 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  43.08 
 
 
752 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  42.08 
 
 
304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  39.86 
 
 
307 aa  215  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0311  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  40.15 
 
 
326 aa  196  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434618  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  37.77 
 
 
311 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0665  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  39.92 
 
 
317 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0276216  normal  0.0192333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0210  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  35.36 
 
 
330 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  0.97527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4333  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  35.5 
 
 
299 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4338  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  33.08 
 
 
305 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4316  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  31.3 
 
 
305 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4185  K+ channel, inward rectifier  31.68 
 
 
305 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49496  predicted protein  23.12 
 
 
526 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  32.26 
 
 
257 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  32.26 
 
 
272 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  27 
 
 
282 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  32.58 
 
 
419 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.23 
 
 
408 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  28.41 
 
 
412 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  39.29 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  33.33 
 
 
272 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  27.61 
 
 
290 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  28.1 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  35.62 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  24.11 
 
 
385 aa  46.6  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42996  predicted protein  26.28 
 
 
684 aa  46.2  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.578593  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  32.26 
 
 
273 aa  46.2  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  27.37 
 
 
275 aa  45.8  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  29.73 
 
 
268 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  30 
 
 
569 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.09 
 
 
409 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  25.76 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  26.06 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  28.97 
 
 
284 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  28.21 
 
 
417 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  28.21 
 
 
417 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  29.73 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  28.21 
 
 
417 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  28.21 
 
 
417 aa  43.9  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  42.47 
 
 
228 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5547  Ion transport 2 domain protein  29.9 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.723458 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  36.84 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  28.21 
 
 
417 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  28.21 
 
 
417 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  28.21 
 
 
417 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  28.21 
 
 
402 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  28.21 
 
 
402 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  33.33 
 
 
367 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  28.18 
 
 
279 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  27.03 
 
 
270 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  30.59 
 
 
306 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  29.55 
 
 
409 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  30.58 
 
 
278 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  29.41 
 
 
430 aa  42.7  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  36.84 
 
 
264 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  30.58 
 
 
278 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  30.58 
 
 
278 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  30.58 
 
 
278 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  30.58 
 
 
278 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  30.26 
 
 
274 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  30.26 
 
 
274 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  30.26 
 
 
274 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  31.4 
 
 
307 aa  42.7  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  29.7 
 
 
344 aa  42.4  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  32.93 
 
 
288 aa  42.4  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  30.26 
 
 
274 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  28.38 
 
 
258 aa  42.4  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>