84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6296 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6296  K+ channel, inward rectifier  100 
 
 
320 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2944  Ion transport 2 domain-containing protein  93.55 
 
 
322 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2965  Ion transport 2 domain-containing protein  93.55 
 
 
322 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2330  K+ channel, inward rectifier, region 2  93.55 
 
 
322 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0632805  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2991  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  90.06 
 
 
321 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2854  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  90.48 
 
 
293 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0327  potassium channel protein  71.94 
 
 
532 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0376  inward rectifier potassium channel  74.19 
 
 
333 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0562  inward rectifier potassium channel  73.95 
 
 
520 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.926063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0395  inward rectifier potassium channel  74.19 
 
 
333 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4289  putative inward rectifier potassium channel  68.58 
 
 
323 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  69.97 
 
 
313 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  72.97 
 
 
307 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0420  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  66.55 
 
 
319 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0341  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  69.77 
 
 
305 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.496756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0326  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  72.24 
 
 
305 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  46.45 
 
 
303 aa  262  6.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2912  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  46.95 
 
 
307 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3184  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  46.95 
 
 
307 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.203496  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4204  K+ channel, inward rectifier, region 2  41.89 
 
 
299 aa  241  9e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0588  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  44.4 
 
 
323 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  40.55 
 
 
304 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3890  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  45.15 
 
 
320 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112226  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  42.42 
 
 
311 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  39.62 
 
 
288 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0665  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  40.67 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0276216  normal  0.0192333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  39.23 
 
 
752 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0311  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  35.96 
 
 
326 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434618  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  36.64 
 
 
311 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0650  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  38.35 
 
 
304 aa  166  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0210  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  32.37 
 
 
330 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  0.97527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4333  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  32.7 
 
 
299 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4338  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  30.39 
 
 
305 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4316  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  30.74 
 
 
305 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4185  K+ channel, inward rectifier  31.01 
 
 
305 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0050  Ion transport 2 domain protein  30.87 
 
 
372 aa  55.8  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49496  predicted protein  20.15 
 
 
526 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  35.87 
 
 
256 aa  52.8  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  26.83 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  26.83 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  29.79 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  34.62 
 
 
253 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  40.74 
 
 
279 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  31.65 
 
 
569 aa  46.2  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  33.33 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  34.43 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  29.73 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  38.18 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  36.84 
 
 
276 aa  44.3  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  40.38 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  32.94 
 
 
386 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  29.29 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  34.12 
 
 
364 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  34.12 
 
 
364 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  29.03 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  31.52 
 
 
272 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  34.12 
 
 
364 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  34.12 
 
 
364 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  29.03 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  28.72 
 
 
276 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44434  predicted protein  24.33 
 
 
430 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.497983  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  28.89 
 
 
284 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  28.89 
 
 
284 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.72 
 
 
409 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  28.89 
 
 
284 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  29.03 
 
 
289 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  35.85 
 
 
258 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  39.68 
 
 
265 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  28.89 
 
 
284 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  31.4 
 
 
430 aa  43.1  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  29 
 
 
276 aa  43.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  35.35 
 
 
276 aa  43.1  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  28.72 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  30.11 
 
 
289 aa  43.1  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  32.95 
 
 
278 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  35 
 
 
276 aa  43.1  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  32.95 
 
 
278 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  32.95 
 
 
278 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  32.95 
 
 
278 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  32.95 
 
 
278 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  32.14 
 
 
275 aa  42.7  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  30 
 
 
277 aa  42.7  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  27.27 
 
 
279 aa  42.4  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  38.89 
 
 
272 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>