44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0050 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0050  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 		 372 aa  752    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0960  Ion transport 2 domain-containing protein  30.52 
 
 		 297 aa  93.2  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0112  hypothetical protein  23.18 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0195  Ion transport 2 domain-containing protein  31.15 
 
 		 311 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0186  Ion transport 2  31.15 
 
 		 311 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.877923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0175  Ion transport 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 290 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.733026  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4107  hypothetical protein  22.62 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4302  Ion transport 2 domain protein  27.27 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0533  hypothetical protein  22.64 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6250  hypothetical protein  22.37 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.818494 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4723  hypothetical protein  25.7 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3488  K+ channel, pore region  23.38 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2281  hypothetical protein  23.08 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2962  hypothetical protein  24.75 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1862  putative membrane associated potassium channel  28.57 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1312  Ion transport 2 domain protein  24.55 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4289  putative inward rectifier potassium channel  35.37 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0420  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  30.08 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6296  K+ channel, inward rectifier  37.8 
 
 		 320 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0327  potassium channel protein  29.66 
 
 		 532 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  29.79 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3716  hypothetical protein  22.47 
 
 		 375 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000943682  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0376  inward rectifier potassium channel  28.97 
 
 		 333 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0395  inward rectifier potassium channel  28.97 
 
 		 333 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1309  Ion transport 2  29.59 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.1844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0562  inward rectifier potassium channel  30.33 
 
 		 520 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.926063  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2965  Ion transport 2 domain-containing protein  35.37 
 
 		 322 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2944  Ion transport 2 domain-containing protein  35.37 
 
 		 322 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2330  K+ channel, inward rectifier, region 2  35.37 
 
 		 322 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0632805  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0341  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  30.95 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.496756 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0261  hypothetical protein  43.75 
 
 		 229 aa  47.8  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2991  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  32 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0326  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  38.98 
 
 		 305 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2854  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  31 
 
 		 293 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5374  hypothetical protein  23.04 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2108  Ion transport 2 domain protein  25.67 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.64507  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  30.95 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  46.3 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  33.82 
 
 		 271 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  35.79 
 
 		 222 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1163  Ion transport 2 domain protein  43.4 
 
 		 247 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  29.25 
 
 		 304 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  31.88 
 
 		 269 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3401  extracellular solute-binding protein family 3  28.67 
 
 		 345 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>