20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1309 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1309  Ion transport 2  100 
 
 		 331 aa  644    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.1844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2962  hypothetical protein  33.82 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1312  Ion transport 2 domain protein  30.36 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2281  hypothetical protein  31.69 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4302  Ion transport 2 domain protein  28.7 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1862  putative membrane associated potassium channel  27.91 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5374  hypothetical protein  30.51 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0112  hypothetical protein  27.69 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0186  Ion transport 2  30.71 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.877923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0195  Ion transport 2 domain-containing protein  30.71 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0175  Ion transport 2 domain-containing protein  30.71 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.733026  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0533  hypothetical protein  27.2 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0050  Ion transport 2 domain protein  28.48 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4107  hypothetical protein  27.12 
 
 		 365 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6250  hypothetical protein  27.67 
 
 		 365 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.818494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3488  K+ channel, pore region  29.22 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0960  Ion transport 2 domain-containing protein  26.24 
 
 		 297 aa  46.2  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4723  hypothetical protein  25.9 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  29.53 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  26.74 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>