18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4302 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4302  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 
333 aa  663    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2281  hypothetical protein  47.75 
 
 
334 aa  318  6e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1862  putative membrane associated potassium channel  43.01 
 
 
369 aa  300  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1312  Ion transport 2 domain protein  42.04 
 
 
335 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2962  hypothetical protein  33.96 
 
 
338 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5374  hypothetical protein  33.23 
 
 
340 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1309  Ion transport 2  30.9 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.1844  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0050  Ion transport 2 domain protein  27.27 
 
 
372 aa  89.7  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0533  hypothetical protein  22.8 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0112  hypothetical protein  22.58 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4107  hypothetical protein  21.77 
 
 
365 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6250  hypothetical protein  24.66 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.818494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3488  K+ channel, pore region  26.05 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4723  hypothetical protein  24.66 
 
 
359 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0195  Ion transport 2 domain-containing protein  28.31 
 
 
311 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0186  Ion transport 2  28.31 
 
 
311 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.877923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0175  Ion transport 2 domain-containing protein  28.31 
 
 
290 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.733026  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0960  Ion transport 2 domain-containing protein  24.76 
 
 
297 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>