15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5374 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5374  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  679    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2962  hypothetical protein  35.29 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2281  hypothetical protein  34.41 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4302  Ion transport 2 domain protein  33.23 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1312  Ion transport 2 domain protein  30 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1862  putative membrane associated potassium channel  31.02 
 
 		 369 aa  152  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1309  Ion transport 2  30.51 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.1844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0533  hypothetical protein  32.39 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3488  K+ channel, pore region  32.43 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0112  hypothetical protein  32.54 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4107  hypothetical protein  30.24 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6250  hypothetical protein  31.13 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.818494 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4723  hypothetical protein  27.11 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0960  Ion transport 2 domain-containing protein  26.32 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0050  Ion transport 2 domain protein  23.04 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>