16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4107 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4107  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  732    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0533  hypothetical protein  81.64 
 
 		 374 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0112  hypothetical protein  83.2 
 
 		 362 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6250  hypothetical protein  68.41 
 
 		 365 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.818494 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4723  hypothetical protein  46.45 
 
 		 359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0050  Ion transport 2 domain protein  22.62 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3488  K+ channel, pore region  29 
 
 		 378 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1312  Ion transport 2 domain protein  23.4 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5374  hypothetical protein  30.24 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1862  putative membrane associated potassium channel  21.99 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4302  Ion transport 2 domain protein  21.77 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2281  hypothetical protein  20.95 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2962  hypothetical protein  25.74 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1309  Ion transport 2  27.7 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.1844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0960  Ion transport 2 domain-containing protein  25.23 
 
 		 297 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3716  hypothetical protein  23.94 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000943682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>