21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3488 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3488  K+ channel, pore region  100 
 
 		 378 aa  765    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3716  hypothetical protein  26.78 
 
 		 375 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000943682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7695  hypothetical protein  30.85 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0112  hypothetical protein  30.58 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0050  Ion transport 2 domain protein  23.38 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0533  hypothetical protein  30.24 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4107  hypothetical protein  29 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1371  hypothetical protein  24.2 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1327  hypothetical protein  24.2 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6250  hypothetical protein  26.16 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.818494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5374  hypothetical protein  32.66 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4723  hypothetical protein  29.65 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4302  Ion transport 2 domain protein  25.3 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1309  Ion transport 2  28.3 
 
 		 331 aa  53.1  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.1844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2962  hypothetical protein  23.48 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0195  Ion transport 2 domain-containing protein  27.42 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0186  Ion transport 2  27.42 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.877923  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1862  putative membrane associated potassium channel  24.92 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0175  Ion transport 2 domain-containing protein  27.42 
 
 		 290 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.733026  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2281  hypothetical protein  25.4 
 
 		 334 aa  50.4  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  34.02 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>