61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0450 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  100 
 
 		 307 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0341  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  81.16 
 
 		 305 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.496756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0326  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  81.63 
 
 		 305 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0562  inward rectifier potassium channel  71.78 
 
 		 520 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.926063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0327  potassium channel protein  70.95 
 
 		 532 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0395  inward rectifier potassium channel  71.78 
 
 		 333 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0376  inward rectifier potassium channel  71.78 
 
 		 333 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2991  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  71.9 
 
 		 321 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2965  Ion transport 2 domain-containing protein  72.97 
 
 		 322 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2944  Ion transport 2 domain-containing protein  72.97 
 
 		 322 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2330  K+ channel, inward rectifier, region 2  72.97 
 
 		 322 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0632805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6296  K+ channel, inward rectifier  72.97 
 
 		 320 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2854  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  74.82 
 
 		 293 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4289  putative inward rectifier potassium channel  64.14 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  65.6 
 
 		 313 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0420  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  61.62 
 
 		 319 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  43.11 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  42.41 
 
 		 304 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4204  K+ channel, inward rectifier, region 2  40.33 
 
 		 299 aa  238  9e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3890  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  46.82 
 
 		 320 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3184  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  43.89 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.203496  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2912  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  43.89 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0588  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  39.72 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  36.82 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  39.77 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0665  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  38.91 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0276216  normal  0.0192333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  37.16 
 
 		 752 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0311  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  34.27 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434618  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  35.25 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0650  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  35.38 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0210  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  31.95 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  0.97527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4333  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  30.1 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4316  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  30.1 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4338  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  28.37 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4185  K+ channel, inward rectifier  28.87 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49496  predicted protein  20.05 
 
 		 526 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  34.62 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  36.47 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  41.38 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0050  Ion transport 2 domain protein  30.95 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  41.18 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  38.71 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  34.07 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  39.19 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  35.71 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  34.12 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  43.14 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  33.33 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  38.46 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  34.12 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  38.18 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  37.84 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  36.08 
 
 		 219 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  34.23 
 
 		 408 aa  43.5  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  29.66 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  34.23 
 
 		 438 aa  43.5  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  35.85 
 
 		 258 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  40.74 
 
 		 272 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  34.62 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  52.38 
 
 		 128 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  36.54 
 
 		 290 aa  42.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>