39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2059 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  100 
 
 
288 aa  592  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0532  K+ channel, inward rectifier  49.23 
 
 
303 aa  259  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3184  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  43.98 
 
 
307 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.203496  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2912  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  43.98 
 
 
307 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0588  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  43.58 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3890  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  42.22 
 
 
320 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112226  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4204  K+ channel, inward rectifier, region 2  45.45 
 
 
299 aa  239  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  42.8 
 
 
311 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0145  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  43.62 
 
 
313 aa  221  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.974479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4289  putative inward rectifier potassium channel  41.39 
 
 
323 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0341  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  41.09 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.496756 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0562  inward rectifier potassium channel  38.93 
 
 
520 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.926063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0376  inward rectifier potassium channel  38.93 
 
 
333 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0395  inward rectifier potassium channel  38.93 
 
 
333 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0450  putative ATP-sensitive inward rectifier potassium channel related transmembrane protein  36.82 
 
 
307 aa  209  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  37.55 
 
 
304 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0420  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  41.39 
 
 
319 aa  208  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0326  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  42.68 
 
 
305 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2854  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  40.38 
 
 
293 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0327  potassium channel protein  36.84 
 
 
532 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2991  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  40.38 
 
 
321 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2965  Ion transport 2 domain-containing protein  40.38 
 
 
322 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2944  Ion transport 2 domain-containing protein  40.38 
 
 
322 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2330  K+ channel, inward rectifier, region 2  40.38 
 
 
322 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0632805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6296  K+ channel, inward rectifier  39.62 
 
 
320 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  36.68 
 
 
752 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0311  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  34.75 
 
 
326 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434618  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3013  K+ channel, inward rectifier  36.82 
 
 
311 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097996 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0650  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  33.33 
 
 
304 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0665  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  32.82 
 
 
317 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0276216  normal  0.0192333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0210  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  29.52 
 
 
330 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  0.97527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4333  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  30.8 
 
 
299 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4338  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  27.51 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4316  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  35.5 
 
 
305 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4185  K+ channel, inward rectifier  27.51 
 
 
305 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49496  predicted protein  22.01 
 
 
526 aa  56.2  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42996  predicted protein  26.04 
 
 
684 aa  49.3  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.578593  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  32.88 
 
 
521 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  48.78 
 
 
269 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>