38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1439 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 		 521 aa  1043    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2426  hypothetical protein  27.69 
 
 		 704 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0317819 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2060  hypothetical protein  30.22 
 
 		 727 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.697893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  45.89 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  40.62 
 
 		 485 aa  98.2  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0126  hypothetical protein  27.29 
 
 		 610 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00047965  normal  0.915629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  39.06 
 
 		 443 aa  94.7  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0269  hypothetical protein  24.36 
 
 		 481 aa  92  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1050  hypothetical protein  30.99 
 
 		 664 aa  90.5  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1689  hypothetical protein  23.54 
 
 		 557 aa  87.8  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3283  hypothetical protein  34.34 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3674  hypothetical protein  23.41 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0475298  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1996  hypothetical protein  25.49 
 
 		 647 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0882712 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1470  hypothetical protein  26.32 
 
 		 732 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00224315  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  42.55 
 
 		 351 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0953  hypothetical protein  26.42 
 
 		 731 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0922952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1183  Ion transport 2 domain protein  40 
 
 		 126 aa  67.8  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.993846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  37.98 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0755  Ion transport 2 domain-containing protein  25 
 
 		 330 aa  62.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1176  hypothetical protein  21.27 
 
 		 646 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  23.72 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  27.33 
 
 		 327 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3430  hypothetical protein  28.39 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  26.54 
 
 		 327 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6675  hypothetical protein  25.3 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00251998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1073  hypothetical protein  25.23 
 
 		 464 aa  53.5  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  27.11 
 
 		 326 aa  52  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6872  hypothetical protein  30.84 
 
 		 362 aa  51.6  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  24.49 
 
 		 485 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1992  hypothetical protein  35.56 
 
 		 641 aa  50.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  24.49 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3591  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.2 
 
 		 945 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  25.61 
 
 		 327 aa  48.5  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3027  Ion transport 2 domain protein  22.22 
 
 		 346 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0650  hypothetical protein  34.45 
 
 		 429 aa  47  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1720  hypothetical protein  20.78 
 
 		 611 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0013  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1121 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  32.88 
 
 		 288 aa  43.5  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>