21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1996 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1996  hypothetical protein  100 
 
 
647 aa  1298    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0882712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0953  hypothetical protein  45.25 
 
 
731 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0922952  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1470  hypothetical protein  42.63 
 
 
732 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00224315  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1050  hypothetical protein  26.82 
 
 
664 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  28.27 
 
 
521 aa  75.1  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1689  hypothetical protein  22.75 
 
 
557 aa  68.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  27.81 
 
 
443 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2060  hypothetical protein  25.45 
 
 
727 aa  60.5  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.697893  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0126  hypothetical protein  25.87 
 
 
610 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00047965  normal  0.915629 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6675  hypothetical protein  33.96 
 
 
412 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00251998  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2426  hypothetical protein  23.39 
 
 
704 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0317819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3283  hypothetical protein  22.09 
 
 
475 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  28.48 
 
 
375 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  30 
 
 
485 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  26.62 
 
 
393 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0269  hypothetical protein  21.59 
 
 
481 aa  51.2  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3591  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.58 
 
 
945 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  34.31 
 
 
351 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1073  hypothetical protein  28.57 
 
 
464 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1094  hypothetical protein  53.7 
 
 
100 aa  47.4  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.864195  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1176  hypothetical protein  22.22 
 
 
646 aa  47  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>