20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0126 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0126  hypothetical protein  100 
 
 
610 aa  1229    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00047965  normal  0.915629 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0269  hypothetical protein  24.39 
 
 
481 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1689  hypothetical protein  22.2 
 
 
557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2060  hypothetical protein  29.46 
 
 
727 aa  103  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.697893  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2426  hypothetical protein  26.05 
 
 
704 aa  87.8  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0317819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  31.3 
 
 
521 aa  87.8  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1050  hypothetical protein  25.54 
 
 
664 aa  74.3  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0953  hypothetical protein  25 
 
 
731 aa  71.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0922952  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1470  hypothetical protein  23.75 
 
 
732 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00224315  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  29.76 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  26.15 
 
 
443 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  26.97 
 
 
485 aa  65.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3283  hypothetical protein  27.67 
 
 
475 aa  64.7  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  29.23 
 
 
393 aa  57.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1996  hypothetical protein  25.87 
 
 
647 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0882712 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0650  hypothetical protein  30.6 
 
 
429 aa  54.3  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  32.95 
 
 
351 aa  50.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3674  hypothetical protein  21.98 
 
 
438 aa  48.9  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0475298  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3430  hypothetical protein  24.31 
 
 
296 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1176  hypothetical protein  22.89 
 
 
646 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>