9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0650 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0650  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  874    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0126  hypothetical protein  30.6 
 
 		 610 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00047965  normal  0.915629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0953  hypothetical protein  29.63 
 
 		 731 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0922952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  40 
 
 		 485 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  34.45 
 
 		 521 aa  47.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  31.91 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3283  hypothetical protein  32.06 
 
 		 475 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  28.78 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1689  hypothetical protein  26.8 
 
 		 557 aa  43.9  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>