23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3283 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3283  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  920    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  32.8 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  34.13 
 
 		 521 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0269  hypothetical protein  28.91 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2426  hypothetical protein  27.63 
 
 		 704 aa  68.2  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0317819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  35.71 
 
 		 485 aa  67  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2060  hypothetical protein  32.18 
 
 		 727 aa  65.1  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.697893  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0126  hypothetical protein  27.67 
 
 		 610 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00047965  normal  0.915629 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1689  hypothetical protein  28.09 
 
 		 557 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  34.93 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  33.59 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0953  hypothetical protein  26.23 
 
 		 731 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0922952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1996  hypothetical protein  22.22 
 
 		 647 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0882712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6872  hypothetical protein  35.92 
 
 		 362 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3430  hypothetical protein  30 
 
 		 296 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1050  hypothetical protein  26.35 
 
 		 664 aa  51.6  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1176  hypothetical protein  25.36 
 
 		 646 aa  50.1  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0032  hypothetical protein  24.24 
 
 		 818 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  32.03 
 
 		 351 aa  47  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1470  hypothetical protein  20.43 
 
 		 732 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00224315  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3591  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.23 
 
 		 945 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0650  hypothetical protein  32.06 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1992  hypothetical protein  29.56 
 
 		 641 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>