19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1992 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1992  hypothetical protein  100 
 
 		 641 aa  1277    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  31.89 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  28.39 
 
 		 485 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  32.79 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3591  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.48 
 
 		 945 aa  74.3  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0029  hypothetical protein  31.72 
 
 		 300 aa  67  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2426  hypothetical protein  34 
 
 		 704 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0317819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  38.04 
 
 		 393 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  26.04 
 
 		 521 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  29.75 
 
 		 351 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1689  hypothetical protein  35.71 
 
 		 557 aa  51.2  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0953  hypothetical protein  32.65 
 
 		 731 aa  50.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0922952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0269  hypothetical protein  38.55 
 
 		 481 aa  49.7  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1073  hypothetical protein  26.48 
 
 		 464 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6872  hypothetical protein  31.88 
 
 		 362 aa  47.4  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3283  hypothetical protein  29.56 
 
 		 475 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3430  hypothetical protein  27.13 
 
 		 296 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1470  hypothetical protein  39.66 
 
 		 732 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00224315  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0126  hypothetical protein  22.33 
 
 		 610 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00047965  normal  0.915629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>