23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0269 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0269  hypothetical protein  100 
 
 
481 aa  970    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1689  hypothetical protein  34.66 
 
 
557 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0126  hypothetical protein  24.39 
 
 
610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00047965  normal  0.915629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  24.06 
 
 
521 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  39.81 
 
 
485 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2060  hypothetical protein  33.18 
 
 
727 aa  73.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.697893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  33.97 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2426  hypothetical protein  30.45 
 
 
704 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0317819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1470  hypothetical protein  23.93 
 
 
732 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00224315  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  30.93 
 
 
443 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3283  hypothetical protein  28.91 
 
 
475 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1050  hypothetical protein  24.44 
 
 
664 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3674  hypothetical protein  21.73 
 
 
438 aa  57.4  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0475298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  32.54 
 
 
393 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0953  hypothetical protein  23.2 
 
 
731 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0922952  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3430  hypothetical protein  25.97 
 
 
296 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1996  hypothetical protein  21.59 
 
 
647 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0882712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1992  hypothetical protein  38.55 
 
 
641 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1176  hypothetical protein  25.25 
 
 
646 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3591  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.97 
 
 
945 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6872  hypothetical protein  30.36 
 
 
362 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0317  hypothetical protein  22.16 
 
 
539 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0032  hypothetical protein  21.72 
 
 
818 aa  43.9  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>