13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0317 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0317  hypothetical protein  100 
 
 
539 aa  1086    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6266  hypothetical protein  37.43 
 
 
523 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.120187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0269  hypothetical protein  39.26 
 
 
490 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0876  hypothetical protein  47.96 
 
 
704 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187127  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2107  hypothetical protein  27.76 
 
 
603 aa  196  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1699  hypothetical protein  28.46 
 
 
577 aa  187  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7051  hypothetical protein  33.01 
 
 
814 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6989  hypothetical protein  30.02 
 
 
712 aa  163  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240907  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38810  hypothetical protein  27.78 
 
 
776 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.707868  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0094  hypothetical protein  44 
 
 
125 aa  107  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395549  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1821  hypothetical protein  31.6 
 
 
428 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400751  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2323  hypothetical protein  25.32 
 
 
310 aa  59.3  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0269  hypothetical protein  21.95 
 
 
481 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>