12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38810 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38810  hypothetical protein  100 
 
 		 776 aa  1581    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.707868  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6989  hypothetical protein  40.03 
 
 		 712 aa  507  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7051  hypothetical protein  33.57 
 
 		 814 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0317  hypothetical protein  27.78 
 
 		 539 aa  150  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0269  hypothetical protein  27.97 
 
 		 490 aa  138  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0876  hypothetical protein  34.12 
 
 		 704 aa  132  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187127  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6266  hypothetical protein  27.97 
 
 		 523 aa  129  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.120187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2107  hypothetical protein  24.42 
 
 		 603 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0094  hypothetical protein  36.29 
 
 		 125 aa  80.5  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1699  hypothetical protein  22.37 
 
 		 577 aa  80.1  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2323  hypothetical protein  24.13 
 
 		 310 aa  56.2  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4786  hypothetical protein  34.44 
 
 		 281 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>