10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2323 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2323  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  633  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1699  hypothetical protein  30.89 
 
 		 577 aa  109  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6266  hypothetical protein  25.9 
 
 		 523 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.120187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2107  hypothetical protein  24.7 
 
 		 603 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0876  hypothetical protein  24 
 
 		 704 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187127  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0317  hypothetical protein  25.32 
 
 		 539 aa  59.3  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6989  hypothetical protein  25.68 
 
 		 712 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240907  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38810  hypothetical protein  24.13 
 
 		 776 aa  56.2  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.707868  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0269  hypothetical protein  26.01 
 
 		 490 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7051  hypothetical protein  23.19 
 
 		 814 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>