27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3430 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3430  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  28.33 
 
 		 443 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  29.24 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  27.87 
 
 		 485 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  28.39 
 
 		 521 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0269  hypothetical protein  25.97 
 
 		 481 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  42.24 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3591  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.7 
 
 		 945 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3283  hypothetical protein  28.5 
 
 		 475 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1073  hypothetical protein  31.34 
 
 		 464 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2426  hypothetical protein  30.56 
 
 		 704 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0317819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0126  hypothetical protein  24.31 
 
 		 610 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00047965  normal  0.915629 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1689  hypothetical protein  25.9 
 
 		 557 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1050  hypothetical protein  21.64 
 
 		 664 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6872  hypothetical protein  33.59 
 
 		 362 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0953  hypothetical protein  19.18 
 
 		 731 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0922952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6675  hypothetical protein  25.74 
 
 		 412 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00251998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1176  hypothetical protein  31.86 
 
 		 646 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  25.93 
 
 		 351 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  34.58 
 
 		 870 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2060  hypothetical protein  28.57 
 
 		 727 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.697893  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1470  hypothetical protein  22.92 
 
 		 732 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00224315  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  26.06 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  34.48 
 
 		 1033 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  36.52 
 
 		 1191 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  41.22 
 
 		 184 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0029  hypothetical protein  34.86 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>