29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1073 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1073  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  951    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  29.17 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  26.24 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  26.06 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  26.16 
 
 
443 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0442  hypothetical protein  34.74 
 
 
397 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0953  hypothetical protein  29.33 
 
 
731 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0922952  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6872  hypothetical protein  24.57 
 
 
362 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  26.18 
 
 
485 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1470  hypothetical protein  31.63 
 
 
732 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00224315  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  26.88 
 
 
521 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  27.27 
 
 
365 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4626  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  28.78 
 
 
602 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1689  hypothetical protein  29.93 
 
 
557 aa  51.6  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3430  hypothetical protein  31.34 
 
 
296 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  21.74 
 
 
368 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 
361 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  18.28 
 
 
365 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1050  hypothetical protein  20.08 
 
 
664 aa  48.9  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1996  hypothetical protein  28.57 
 
 
647 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0882712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  27.36 
 
 
354 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2426  hypothetical protein  26.26 
 
 
704 aa  47.8  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0317819 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6675  hypothetical protein  29.79 
 
 
412 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00251998  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3591  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  25 
 
 
945 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3674  hypothetical protein  23.29 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0475298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  26.6 
 
 
313 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1992  hypothetical protein  30.23 
 
 
641 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2060  hypothetical protein  29.17 
 
 
727 aa  44.3  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.697893  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0029  hypothetical protein  31.03 
 
 
300 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>