28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2426 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2426  hypothetical protein  100 
 
 
704 aa  1397    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0317819 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2060  hypothetical protein  41.21 
 
 
727 aa  476  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.697893  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1176  hypothetical protein  26.55 
 
 
646 aa  110  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  36.79 
 
 
521 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1050  hypothetical protein  25.3 
 
 
664 aa  89  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1689  hypothetical protein  28.47 
 
 
557 aa  87.8  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0126  hypothetical protein  26.05 
 
 
610 aa  87.4  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00047965  normal  0.915629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  37.58 
 
 
375 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0953  hypothetical protein  27.05 
 
 
731 aa  74.7  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0922952  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0269  hypothetical protein  30.45 
 
 
481 aa  68.6  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3283  hypothetical protein  27.63 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  33.99 
 
 
393 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1470  hypothetical protein  23.45 
 
 
732 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00224315  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  30 
 
 
443 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  31.31 
 
 
485 aa  57.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1720  hypothetical protein  22.84 
 
 
611 aa  55.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3674  hypothetical protein  22.06 
 
 
438 aa  54.7  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0475298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1992  hypothetical protein  34 
 
 
641 aa  54.3  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  30.25 
 
 
351 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6872  hypothetical protein  36.79 
 
 
362 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1996  hypothetical protein  20.47 
 
 
647 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0882712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3430  hypothetical protein  30.56 
 
 
296 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  24.55 
 
 
881 aa  48.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1073  hypothetical protein  26.26 
 
 
464 aa  48.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3027  Ion transport 2 domain protein  26.16 
 
 
346 aa  47.4  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3591  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.75 
 
 
945 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6675  hypothetical protein  23.86 
 
 
412 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00251998  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  23.5 
 
 
327 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>