25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1689 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1689  hypothetical protein  100 
 
 
557 aa  1140    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0269  hypothetical protein  35.44 
 
 
481 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0126  hypothetical protein  23.32 
 
 
610 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00047965  normal  0.915629 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2426  hypothetical protein  28.47 
 
 
704 aa  87.8  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0317819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  34.32 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1050  hypothetical protein  23.06 
 
 
664 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  23.54 
 
 
521 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1470  hypothetical protein  26.54 
 
 
732 aa  77  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00224315  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  35.29 
 
 
485 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2060  hypothetical protein  28.03 
 
 
727 aa  75.5  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.697893  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0953  hypothetical protein  24.2 
 
 
731 aa  73.9  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0922952  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1996  hypothetical protein  22.75 
 
 
647 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0882712 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3674  hypothetical protein  24.06 
 
 
438 aa  66.6  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0475298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3283  hypothetical protein  31.28 
 
 
475 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  26.57 
 
 
393 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6675  hypothetical protein  24.86 
 
 
412 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00251998  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1176  hypothetical protein  24.42 
 
 
646 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  30.82 
 
 
375 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1073  hypothetical protein  29.93 
 
 
464 aa  51.6  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1992  hypothetical protein  35.71 
 
 
641 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  32.23 
 
 
351 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3430  hypothetical protein  25.9 
 
 
296 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6872  hypothetical protein  32.65 
 
 
362 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  25.93 
 
 
326 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0650  hypothetical protein  26.8 
 
 
429 aa  43.9  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.829817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>