239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0810 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  682    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  83.69 
 
 		 327 aa  580  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  80.92 
 
 		 327 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  80.94 
 
 		 327 aa  551  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0755  Ion transport 2 domain-containing protein  69.97 
 
 		 330 aa  478  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3027  Ion transport 2 domain protein  29.18 
 
 		 346 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  40.95 
 
 		 213 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  42.05 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  36.44 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  36.44 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1183  Ion transport 2 domain protein  35.78 
 
 		 126 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.993846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  37.65 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  37.65 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  40.45 
 
 		 900 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  40.22 
 
 		 234 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  38.2 
 
 		 441 aa  57  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  40.86 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  38.37 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  32.2 
 
 		 448 aa  55.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.37 
 
 		 222 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  41.11 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  35.58 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  35.58 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  40.22 
 
 		 537 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  32.62 
 
 		 255 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  42.68 
 
 		 168 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  37.78 
 
 		 745 aa  53.5  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  35.77 
 
 		 320 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  33.75 
 
 		 182 aa  53.5  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  41.11 
 
 		 180 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 734 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  36.64 
 
 		 521 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  38.14 
 
 		 973 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1176  hypothetical protein  27.68 
 
 		 646 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  45.71 
 
 		 266 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  40.96 
 
 		 325 aa  52.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 		 567 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  34.48 
 
 		 489 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  33.05 
 
 		 225 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  35.96 
 
 		 182 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  33.33 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  37.23 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 165 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  40.24 
 
 		 172 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 179 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  32.8 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  38.82 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  32.8 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  41.11 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  41.11 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  27.11 
 
 		 521 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1915  pentapeptide repeat protein  38.89 
 
 		 149 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1941  pentapeptide repeat protein  38.89 
 
 		 149 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  40.7 
 
 		 386 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  36.73 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  29.95 
 
 		 514 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  33.02 
 
 		 776 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  40.7 
 
 		 493 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  39.58 
 
 		 260 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 266 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4194  pentapeptide repeat protein  39 
 
 		 223 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  43.28 
 
 		 264 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  38.95 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1634  pentapeptide repeat-containing protein  38.75 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3289  pentapeptide repeat containing protein  31.82 
 
 		 237 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.051928  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  40.7 
 
 		 517 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  43.9 
 
 		 243 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  39.33 
 
 		 309 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  33.96 
 
 		 1807 aa  50.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  37.08 
 
 		 286 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2772  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 129 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  37.8 
 
 		 1033 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 292 aa  49.7  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  38.2 
 
 		 214 aa  49.7  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  39.24 
 
 		 187 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  41.38 
 
 		 249 aa  49.3  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  43.75 
 
 		 202 aa  49.3  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  36.08 
 
 		 447 aa  49.3  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  34.04 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  30.94 
 
 		 515 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  37.63 
 
 		 130 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.19 
 
 		 525 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  35.58 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  34.78 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  37.08 
 
 		 190 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  36.67 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  38.82 
 
 		 483 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  36.79 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  36.9 
 
 		 143 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 576 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1294  serine/threonine protein kinase  44.26 
 
 		 522 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0950  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 		 108 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  34.58 
 
 		 449 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  36.14 
 
 		 491 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  42.86 
 
 		 526 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  40.51 
 
 		 450 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  35.58 
 
 		 217 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>