More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0415 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  639    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2505  pentapeptide repeat protein  32.6 
 
 		 371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3601  pentapeptide repeat protein  32.6 
 
 		 371 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4526  pentapeptide repeat protein  37.94 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.51706 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  37.61 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  44.95 
 
 		 286 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  43.31 
 
 		 1033 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  43.1 
 
 		 517 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  43.9 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  43.64 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 		 567 aa  80.5  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  34.46 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  41.41 
 
 		 213 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  40.16 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  36.29 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  40.87 
 
 		 176 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  40.16 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  38.21 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  40.87 
 
 		 176 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  41.13 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4307  pentapeptide repeat-containing protein  41.74 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.154552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  39.64 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  40.52 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  43.4 
 
 		 446 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  41.04 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  40.69 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 		 533 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.87 
 
 		 14916 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  46.36 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  39.64 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  38.84 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1060  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 157 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  42.86 
 
 		 745 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  40.19 
 
 		 600 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  42.28 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  35.14 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  41.82 
 
 		 710 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  39.02 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  36.57 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  41.53 
 
 		 521 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  44.55 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  47.62 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  41.03 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  41.41 
 
 		 408 aa  72.4  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  37.84 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  41.22 
 
 		 215 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  42.28 
 
 		 411 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  39.25 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  39.85 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  39.25 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  42.11 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  46.3 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  36.92 
 
 		 734 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  42.11 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  42.27 
 
 		 143 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  48.39 
 
 		 576 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  37.4 
 
 		 524 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2153  pentapeptide repeat-containing protein  45.79 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.281285  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  42.71 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  45.63 
 
 		 973 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  36.43 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  35.94 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  42.27 
 
 		 900 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  39.81 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  35.29 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  45.05 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  40.41 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  41.51 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  40.48 
 
 		 256 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  45.74 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  46.15 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  41.73 
 
 		 203 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  31.4 
 
 		 961 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  37.31 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  43.01 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.7 
 
 		 525 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  37.76 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  39.45 
 
 		 165 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  41.35 
 
 		 174 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  35.17 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  38.74 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  38.32 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  38.32 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  35.48 
 
 		 250 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0362  pentapeptide repeat-containing protein  39.13 
 
 		 163 aa  67  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571178  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2937  hypothetical protein  39.34 
 
 		 393 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.807989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  38.1 
 
 		 356 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  34.62 
 
 		 442 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  42.62 
 
 		 456 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  34 
 
 		 412 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  34.62 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  39.81 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  41.12 
 
 		 493 aa  66.6  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  42.11 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  47.78 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  41.82 
 
 		 175 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  37.3 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>