More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1634 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1634  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 302 aa  620  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0207  pentapeptide repeat protein  53.92 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000258172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0190  pentapeptide repeat protein  52.94 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.37345e-35 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  52.94 
 
 		 152 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  48.19 
 
 		 525 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  45.74 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  45.36 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  45.05 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  53.01 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  48.81 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2153  pentapeptide repeat-containing protein  39.81 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.281285  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  46.32 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  48 
 
 		 734 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  48.28 
 
 		 151 aa  67  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  45.88 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  48.78 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  47.13 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  46.91 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  48.91 
 
 		 181 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  36.6 
 
 		 184 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  48.19 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  41.75 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  46.84 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  42.59 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  43.75 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 576 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  33.77 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 517 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  44.94 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  54.93 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  51.22 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  52.78 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  42.11 
 
 		 537 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  42.57 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  46.74 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  39.09 
 
 		 973 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  44.19 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  42.57 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  35.66 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  37.62 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  43.53 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  38.81 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  37.29 
 
 		 866 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  45.12 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  41.28 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 900 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  37.7 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  45 
 
 		 903 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  37.29 
 
 		 452 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  45.68 
 
 		 540 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  47.62 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  50.75 
 
 		 1191 aa  59.3  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  46.74 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3924  pentapeptide repeat-containing protein  38.14 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  35.23 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  32.58 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  49.35 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4818  pentapeptide repeat-containing protein  44.83 
 
 		 122 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682722  normal  0.144232 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  43.53 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  39.8 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  38.64 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  45 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  42.53 
 
 		 149 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  42.53 
 
 		 149 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  47.22 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  41.57 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  49.28 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  42.59 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  43.02 
 
 		 567 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  48.61 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.84 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  39.6 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2272  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 		 681 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  42.31 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  41.03 
 
 		 949 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  50.75 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  46.25 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  47.14 
 
 		 872 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  46.15 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  34.29 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  38.84 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  37.96 
 
 		 1033 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  51.28 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  46.15 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  38.84 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  40.82 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  47.14 
 
 		 401 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  47.14 
 
 		 401 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  35.64 
 
 		 862 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1060  pentapeptide repeat-containing protein  43.02 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  46.67 
 
 		 142 aa  57  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  40.4 
 
 		 440 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  42.67 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  44.29 
 
 		 776 aa  56.6  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1533  pentapeptide repeat-containing protein  43.21 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  45.21 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 		 453 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>