More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1060 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1060  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 157 aa  306  6.999999999999999e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  48.7 
 
 		 234 aa  84.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  45.95 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  43.65 
 
 		 776 aa  83.6  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  44.7 
 
 		 340 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  44.26 
 
 		 286 aa  80.5  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  48.28 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  47.11 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  46.36 
 
 		 521 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  39.86 
 
 		 362 aa  77.4  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  47.47 
 
 		 900 aa  77.4  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  49.09 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  47.5 
 
 		 493 aa  76.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  39.58 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 		 576 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.35 
 
 		 525 aa  76.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  46.22 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  47.37 
 
 		 489 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  43.48 
 
 		 446 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  47.32 
 
 		 384 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  47.27 
 
 		 320 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  41.58 
 
 		 961 aa  74.7  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  37.5 
 
 		 325 aa  74.7  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  42.31 
 
 		 267 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  40.15 
 
 		 277 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  45.52 
 
 		 225 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  48.54 
 
 		 309 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  47.01 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  47.01 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  47.5 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  44.63 
 
 		 567 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  46.9 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  47.32 
 
 		 449 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  42.37 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  40.68 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  46.72 
 
 		 184 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  40.77 
 
 		 447 aa  72  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  45.95 
 
 		 234 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  49.51 
 
 		 1033 aa  72  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  45.95 
 
 		 234 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  40.41 
 
 		 206 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  43.2 
 
 		 343 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  43.2 
 
 		 343 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  45.45 
 
 		 440 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  47.37 
 
 		 268 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  43.09 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  47.37 
 
 		 256 aa  71.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  37.33 
 
 		 420 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  43.2 
 
 		 745 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  41.94 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  44.26 
 
 		 401 aa  70.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 450 aa  70.9  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  44.26 
 
 		 401 aa  70.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  44.92 
 
 		 182 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  41.27 
 
 		 903 aa  70.5  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  47.78 
 
 		 273 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  49.09 
 
 		 311 aa  70.5  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  42.54 
 
 		 241 aa  70.5  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  39.26 
 
 		 336 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  39.26 
 
 		 336 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  45.13 
 
 		 309 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  45.54 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  44.54 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  38.13 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  42.34 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  41.03 
 
 		 448 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  46.49 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  43.59 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  46.36 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  43.08 
 
 		 517 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  43.48 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  37.88 
 
 		 366 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  33.97 
 
 		 389 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  42.98 
 
 		 515 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  35.03 
 
 		 250 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  47.01 
 
 		 351 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  38.39 
 
 		 267 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  43.9 
 
 		 319 aa  68.2  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  42.74 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  40.98 
 
 		 537 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  43.1 
 
 		 215 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  43.41 
 
 		 250 aa  67.4  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  37.39 
 
 		 453 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  43.81 
 
 		 189 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  48.31 
 
 		 278 aa  67  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  38.66 
 
 		 420 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  44.74 
 
 		 219 aa  67  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  38.06 
 
 		 734 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  43.1 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  43.27 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  43.12 
 
 		 412 aa  67  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  42.15 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  38.05 
 
 		 600 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  38.06 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  37.72 
 
 		 485 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>