More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0707 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  34.38 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.57 
 
 		 525 aa  102  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 381 aa  95.9  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  32.82 
 
 		 333 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1438  pentapeptide repeat protein  28.74 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0273991  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  31.52 
 
 		 866 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  28.71 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  35.03 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  33.95 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  33.56 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  37.14 
 
 		 175 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  32.39 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  34.21 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  37.39 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  34.21 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  31.25 
 
 		 734 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  28.99 
 
 		 949 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  24.47 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  25.12 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  29.94 
 
 		 872 aa  76.3  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  29.83 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  25.12 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  30.94 
 
 		 881 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  34.01 
 
 		 567 aa  76.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  28.35 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  34.42 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  27.72 
 
 		 401 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  28.87 
 
 		 266 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  29.27 
 
 		 366 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  31.51 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  27.72 
 
 		 401 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  28.41 
 
 		 449 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  32.39 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  31.41 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  29.71 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  34.32 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  31.03 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  32.28 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  34.72 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  28.78 
 
 		 846 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  30.95 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  26.95 
 
 		 844 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  34.29 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  34.33 
 
 		 900 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  29.75 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  30.97 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  32.28 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  33.55 
 
 		 576 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  29.09 
 
 		 489 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  30.32 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  33.12 
 
 		 825 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  30.41 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  24.41 
 
 		 872 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  31.97 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  29.56 
 
 		 384 aa  72.4  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  32.65 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  26.37 
 
 		 319 aa  72  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  28.68 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  32 
 
 		 311 aa  72  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  32.65 
 
 		 727 aa  72  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  29.35 
 
 		 279 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  34.78 
 
 		 315 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  29.33 
 
 		 448 aa  72  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  29.35 
 
 		 279 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  29.25 
 
 		 903 aa  71.6  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  33.94 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  30.81 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  28.49 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 		 862 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  29.94 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  31.33 
 
 		 862 aa  70.5  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  32.52 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  31.41 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4879  pentapeptide repeat-containing protein  32.93 
 
 		 657 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.511853 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  29.35 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  28.49 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  29.28 
 
 		 521 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1634  pentapeptide repeat-containing protein  45.05 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364584  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  29.35 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  29.8 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  32.47 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 		 825 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 		 825 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 		 825 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  30 
 
 		 452 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 		 825 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  32.35 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  32.35 
 
 		 485 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 		 533 aa  69.3  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  33.77 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  27.95 
 
 		 416 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  35.43 
 
 		 540 aa  68.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  29.27 
 
 		 517 aa  68.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 		 825 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 		 524 aa  68.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>